Киё и Сумирэ приехали в Киото из префектуры Аомори, чтобы стать гейшами. Киё не проходит отбор, однако остается в доме майко в качестве кухарки, чтобы поддержать подругу, успешно справившуюся с заданиями.

Однажды старшеклассница Акари Амано теряется в лесу. На помощь ей приходит милая юная 360-летняя вампирша по имени Софи Твайлайт, проживающая в особняке в лесной чаще. С этого момента Акари начинает испытывать интерес к привыкшей к одиночеству Софи и переезжает к ней жить.

Ящик знаний — пространство без гравитации с неисчислимым количеством сияющих различными цветами огней. Внутри него находится множество временных потоков и миров, используемых для существования многих людей, и в которых Дуал и Дороти сражаются с врагами, именуемыми Вирусами. Заражённые Вирусами миры должны быть уничтожены, и это — долг и работа этих девушек. Однажды они