Во время пребывания в Америке Такэру и Хикари видят, как внезапно появившийся ветер проносится над миром и уносит избранных детей. Хикари чувствует присутствие «плачущего дигимона». Настало время новой битвы.

Новому интернет-вирусу под названием Дигимон удается распространиться по всей Японии. Уничтожая все больше и больше данных, он продолжает эволюционировать. Таити и Кусиро решают, что пришло время исправить ситуацию. Но остановить вирус, контролирующий военные американские системы, не так-то просто.