В Японии происходит ряд убийств. Возле тел всех погибших находят кость маджонга масти пин разного достоинства. Японская полиция подозревает, что это дело рук серийного убийцы и созывает инспекторов со всех префектур Японии для расследования. Кроме того, по специальному приглашению, к расследованию присоединяется и Когоро Мори. Конан узнаёт детали совещания полиции, а также

Эдогава Конан, Мори Ран (毛利 蘭), Мори Когоро (毛利 小五郎) и Судзуки Соноко (鈴木園子) вместе с другими гостями приглашены попробовать новейшую виртуальную игру на вечеринке, где вскоре происходит загадочное убийство. И теперь Конану предстоит раскрыть преступление, выяснив личность убийцы как в реальном, так и в виртуальном мирах, ведь жизни сорока девяти людей, участвующих в игре,

Во время церемонии открытия новых небоскрёбов происходит серия убийств. Конан Эдогава немедленно приступает к расследованию, но вскоре здание сотрясает мощный взрыв.

Ран становится свидетелем убийства детектива Сато. От шока она теряет память. Детектив Конан должен помочь ей восстановить память и найти убийцу.

Девушка Кото попадает в параллельную реальность. Чтобы найти ключ к возвращению в свой мир, Кото предстоит отправиться в полное опасностей путешествие.

События происходят через некоторое время после окончания первого сезона. ] Ёко занимается подводными исследованиями около Мадагаскара, Мадока более не способная запустить «глаз ауры», отправляется в Камогаву. Дома она обнаруживает письма от Лан и Мугинами, в которых они пишут о своей текущей жизни и поздравляют её с Новым Годом. Спустя месяцы заканчивается и очередной учебный

Детектив Конан противостоит сумасшедшему взрывателю. Обезвреживая бомбы одну за другой, Конан должен успеть остановить его прежде, чем он взорвёт огромный небоскрёб в центре города.

Муми-тролль и его друзья отправляются в обсерваторию, которая расположена в Одиноких горах, чтобы узнать, когда на Землю упадёт комета.