Парни Ран, Сюта и Коки дружат с детства, и все трое выросли в одном округе Токио. Однажды после странного происшествия у них одновременно начинают звонить телефоны, а таинственный голос в трубке призывает их «выбрать будущее».

События разворачиваются в частной школе для девочек. Все ученицы десятого класса Курогуми - наемные убийцы, подосланные с единственной целью — убить Хару Итиносэ. Токаку Адзума — новенькая в классе — так же из их числа, однако вопреки поставленной задаче неожиданно для себя начинает осознавать постепенно растущие чувства к своей жертве...

Таинственный враг, появившийся из глубин морей, захватил контроль над всеми морями мира. Только девушки, обладающие душами военных кораблей времен второй мировой войны, могут противостоять «Флоту глубоководного моря». После потери базы, благодаря стратегии Адмирала, девочки-корабли одержали победу, но после их жестокого боя, борьба становилась все более ожесточенной.