Мир на грани уничтожения, а обязанность защищать его теперь ложится на плечи Сиро Эмии. Но ценой спасения человечества может стать жизнь его младшей сестры Мию.

Фильм представляет собой пересказ основных событий двух сезонов сериала — «Заражение WIXOSS» и «Распространение WIXOSS» — с добавлением нескольких новых сцен. Также «Разрушение» более подробно рассказывает о Руко Коминато, Улит и новом персонаже Сати Тогасаки.

Война за Святой Грааль — невероятное сражение, где маги и призванные ими герои прошлого сражаются насмерть за исполнение одного-единственного желания. Положению Сиро Эмии не позавидуешь: в ход Войны вмешивается таинственное существо в маске, а Слуга Сэйбер, его верная соратница, исчезла. Войну можно считать проигранной, но он не может просто сдаться — ведь битва магов

В поисках мистического ингредиента, известного как Небесная рыба, Мелиодас и Ястреб внезапно переносятся в королевство Храм неба, населенное существами, которых называют небожители. По прибытии выясняется, что Мелиодас поразительно похож на местного преступника, и его сажают в тюрьму. В это же время шесть тёмных рыцарей готовятся напасть на Храм неба, чтобы уничтожить

Три года прошло с момента окончания войны между джовианцами и землянами. Акито и Юрика считаются погибшими в крушении шаттла, случившемся годом позже. Малышка Рури Хосино продолжает нести службу, но уже сама командуя Надэсико. Благодаря успешному изучению бозоновых прыжков была начата реализация «Плана Хисаго» — создание обширной сети порталов, окажись которая не в тех руках,

Сора, Лейла и Мэй изучают язык тюленей и учатся готовить.

Прошло несколько лет после роспуска первой команды Боргмена. Бывшие члены группы, Рё Хибики, Анис Фарм и Чак Суэгер, сталкиваются с армией нежити.

Лейла готовится к важному выступлению на Бродвее. Вспоминая моменты прошлого, она решает отправиться в путешествие на велосипеде, чтобы вновь обрести себя.

На горе Гинко натыкается на девушку, из тела которой растут ветви с листьями. Вскоре он поймёт, что она является хранителем горы, и встретит её брата, который уже давно ищет сестру.